Een goede begeleiding van de leerlingen vinden we op het ATC erg belangrijk. Elke leerling heeft een gedurende de hele schoolperiode een mentor, die er op let hoe het met de leerling gaat. Vierdeklassers spelen een belangrijke rol in de opvang en begeleiding van de nieuwe brugklasleerlingen. Iedere brugklas krijgt drie leerlingbegeleiders toegewezen en zij hebben veel contact met de leerlingen en zijn bij veel van de activiteiten.

Van belang bij de begeleiding zijn de resultaten van de leerling, maar ook of de leerling zich op school op zijn gemak voelt. De mentor praat regelmatig met zijn mentorleerlingen als groep en ook met elke leerling afzonderlijk. De mentor zorgt in de tweede en derde klas voor het voorbereiden van de leerlingen op de keuzes die ze in de bovenbouw en in het vervolgonderwijs moeten maken. De mentoren worden bij de keuzebegeleiding ondersteund door de schooldecaan.

De mentor is de vertrouwde persoon bij wie de leerling altijd terecht kan. Er is overigens ook veel contact tussen de mentor en de ouders van de leerling. In de eerste klassen zijn er per klas twee mentoren. In de bovenbouwklassen is er steeds aan een groep leerlingen (8 á 10) een tutor toegekend met dezelfde taakomschrijving als de mentor.

De docenten beperken zich niet tot lesgeven alleen. Begeleiding van leerlingen is ook een verantwoordelijkheid van elke vakdocent. Daarnaast is er een vertrouwenspersoon/coordinator leerlingzaken, die voor de leerlingen klaarstaat als er problemen spelen die wat ingewikkelder liggen. Zij kan de leerling eventueel doorverwijzen naar andere hulpinstanties.

De decaan, Karen van Herwaarde, is degene die het keuzeproces begeleidt. Zij weet (bijna) alles over vervolgopleidingen en beroepen. Bij haar komt ook alle informatie binnen over bijvoorbeeld open dagen, toelatingsprocedures, studietoelagen, internationale stages e.d. Zij kan met leerlingen uitzoeken waar hun belangstelling naar uitgaat en op heel gedetailleerde vragen ingaan.